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兼營秋刀魚棒受網漁船每年漁季作業期間透過漁船監控系統，自動回報船位紀錄中斷日數累計達二十日，不得申領次年作業證明書，但已依漁業法核處罰鍰並執行完畢者，得申領赴北太平洋國外基地作業證明書（廢止）	106-07-28
赴西南大西洋海域魷釣漁船及運搬船請領作業證明書相關規定（廢止）	106-07-14
魷釣漁船及漁業專用漁獲物運搬船赴大陸地區港口卸售漁獲物應行遵守及注意事項（廢止）	106-07-14
申請及核發輸韓國秋刀魚漁獲證明書作業要點（廢止）	106-07-14
一百零二年度漁船赴三大洋從事南方黑鮪作業應行遵守及注意事項（廢止）	106-07-14
一百零一年度漁船赴三大洋海域從事南方黑鮪作業應行遵守及注意事項（廢止）	106-07-14
南方黑鮪產地漁業證明書有效期限為四個月（廢止）	106-07-14
國外基地作業或參加國外漁業合作漁船申請核發黑鮪漁獲證明書作業規定（廢止）	106-07-14
南方黑鮪漁業證明書（CCSBT SOUTHERN BLUEFIN TUNA CATCH DOCUMENT）申請核發作業要點（廢止）	106-07-14
一百年度我國漁船赴三大洋海域從事南方黑鮪作業應行遵守及注意事項（廢止）	106-07-14
我國漁船不得在公海捕撈或持有鮭鱒魚，非經中央主管機關核准不得在他國經濟海域捕撈鮭鱒魚漁業合作（停止適用）	106-07-11
公告太平洋禁止作業水域（停止適用）	106-07-11
赴北太平洋海域魷釣秋刀魚棒受網漁船及運搬船應行遵守及注意事項（廢止）	106-07-07
赴大西洋從事捕撈鮪、旗魚類漁船「國外基地作業證明書」有效期限放寬為二年六個月（廢止）	106-07-07
漁業專用漁獲物運搬船與作業漁船合組船團共同作業應行遵守及注意事項（廢止）	106-07-07
魷釣漁船阿根廷魷漁獲物交由外國籍運搬船駁運裝櫃返國作業要點（廢止）	106-07-07
遠洋延繩釣作業漁船赴中西太平洋以合組船團方式從事專營漁獲物運搬船港內轉載應行遵守及注意事項（廢止）	106-07-07
一百年度赴北太平洋從事秋刀魚棒受網漁業漁船應行遵守及注意事項（廢止）	106-07-07
一百零五年度未滿一百噸赴太平洋印度洋從事捕撈鮪類及類鮪類作業漁船電子回報漁獲資料輔導措施（廢止）	106-07-07
魷釣兼營秋刀魚棒受網漁船秋刀魚漁獲物交由外國籍運搬船於國外港口卸售應行遵守及注意事項（廢止）	106-07-07